农垦系统由中央和地方管理机构、国有农垦企业集团、基层农场与牧场单位、科研教育机构以及配套服务单位等多层级单位构成，形成“管理统筹、集团经营、基层生产、科研支撑”的组织结构。其特点是规模化经营、组织化程度高、机械化水平强，并承担国家重要农产品生产任务。随着改革深化与数字化推进，农垦系统正向企业化、专业化和智慧农业方向发展，在保障粮食安全和农业现代化中发挥持续作用。