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如何用python绘制各国疫情

如何用python绘制各国疫情

要用Python绘制各国疫情图表,你可以使用多个Python库,如Matplotlib、Seaborn、Plotly和Pandas。主要步骤包括获取疫情数据、处理数据并绘制图表。 其中,获取数据可以通过API或下载CSV文件来实现;数据处理包括清洗数据、处理缺失值等;绘制图表时,可以选择适合的图表类型,如折线图、条形图或地图。在此过程中,数据的准确性和可视化的清晰度非常重要。

一、获取疫情数据

获取疫情数据是绘制疫情图表的第一步。通常可以通过以下几种方式获取:

1、使用API获取数据

有许多网站和机构提供了COVID-19疫情数据的API接口。例如,Johns Hopkins University (JHU)和World Health Organization (WHO)等。以下是如何使用COVID-19 API从JHU获取数据的示例:

import requests

import pandas as pd

通过API获取数据

url = "https://api.covid19api.com/summary"

response = requests.get(url)

data = response.json()

将数据转换为DataFrame

df = pd.json_normalize(data['Countries'])

print(df.head())

2、使用CSV文件

有些网站提供疫情数据的CSV文件下载,例如Our World in Data。下载CSV文件后,可以使用Pandas库读取数据。

import pandas as pd

从CSV文件读取数据

df = pd.read_csv("path_to_your_file.csv")

print(df.head())

二、数据处理

在获取到数据后,需要对数据进行处理,包括清洗数据、处理缺失值、数据转换等。

1、清洗数据

数据清洗是指删除或修正不准确的数据。比如,删除重复行或填补缺失值。

# 删除重复行

df.drop_duplicates(inplace=True)

处理缺失值

df.fillna(0, inplace=True)

2、数据转换

数据转换是将数据转换为适合分析的格式。比如,将日期字符串转换为日期对象。

# 将日期字符串转换为日期对象

df['Date'] = pd.to_datetime(df['Date'])

三、绘制疫情图表

绘制图表是数据可视化的重要部分。可以使用Matplotlib、Seaborn或Plotly库来绘制各种图表。

1、使用Matplotlib绘制折线图

Matplotlib是Python中最基本的绘图库之一,适合绘制简单的图表。

import matplotlib.pyplot as plt

绘制折线图

plt.figure(figsize=(10, 6))

plt.plot(df['Date'], df['Confirmed'], label='Confirmed Cases')

plt.plot(df['Date'], df['Deaths'], label='Deaths')

plt.plot(df['Date'], df['Recovered'], label='Recovered')

plt.xlabel('Date')

plt.ylabel('Number of Cases')

plt.title('COVID-19 Cases Over Time')

plt.legend()

plt.show()

2、使用Seaborn绘制条形图

Seaborn是基于Matplotlib的高级绘图库,适合绘制统计图表。

import seaborn as sns

绘制条形图

plt.figure(figsize=(12, 8))

sns.barplot(x='Country', y='Confirmed', data=df)

plt.xticks(rotation=90)

plt.xlabel('Country')

plt.ylabel('Number of Confirmed Cases')

plt.title('Confirmed COVID-19 Cases by Country')

plt.show()

3、使用Plotly绘制地图

Plotly是一个交互式绘图库,适合绘制动态和交互式图表。

import plotly.express as px

绘制地图

fig = px.choropleth(df, locations="Country", locationmode='country names',

color="Confirmed", hover_name="Country",

color_continuous_scale=px.colors.sequential.Plasma)

fig.update_layout(title='Confirmed COVID-19 Cases by Country')

fig.show()

四、数据分析与洞察

在绘制完图表后,可以进行数据分析和洞察,以了解疫情的趋势和影响。

1、趋势分析

通过折线图,可以观察确诊、死亡和康复病例的趋势,分析疫情的变化情况。

# 计算每日新增病例

df['New Cases'] = df['Confirmed'].diff()

df['New Deaths'] = df['Deaths'].diff()

绘制每日新增病例的折线图

plt.figure(figsize=(10, 6))

plt.plot(df['Date'], df['New Cases'], label='New Cases')

plt.plot(df['Date'], df['New Deaths'], label='New Deaths')

plt.xlabel('Date')

plt.ylabel('Number of New Cases/Deaths')

plt.title('Daily New COVID-19 Cases and Deaths Over Time')

plt.legend()

plt.show()

2、国家比较

通过条形图,可以比较不同国家的疫情情况,了解哪些国家受疫情影响最严重。

# 筛选出确诊病例最多的10个国家

top_10_countries = df.groupby('Country')['Confirmed'].sum().nlargest(10).index

df_top_10 = df[df['Country'].isin(top_10_countries)]

绘制条形图

plt.figure(figsize=(12, 8))

sns.barplot(x='Country', y='Confirmed', data=df_top_10)

plt.xticks(rotation=90)

plt.xlabel('Country')

plt.ylabel('Number of Confirmed Cases')

plt.title('Top 10 Countries with the Most Confirmed COVID-19 Cases')

plt.show()

3、区域分析

通过地图,可以进行区域分析,了解疫情在不同地区的分布情况。

import geopandas as gpd

读取世界地图数据

world = gpd.read_file(gpd.datasets.get_path('naturalearth_lowres'))

合并疫情数据和地图数据

df_world = world.merge(df, how="left", left_on="name", right_on="Country")

绘制地图

ax = df_world.plot(column='Confirmed', cmap='OrRd', figsize=(15, 10), legend=True,

legend_kwds={'label': "Number of Confirmed Cases",

'orientation': "horizontal"})

ax.set_title("COVID-19 Confirmed Cases by Country")

plt.show()

五、数据预测

除了绘制现有数据的图表,还可以进行疫情数据的预测。常用的方法有时间序列分析和机器学习模型。

1、时间序列分析

时间序列分析可以帮助预测未来的疫情趋势。可以使用ARIMA模型来进行时间序列预测。

from statsmodels.tsa.arima_model import ARIMA

选择时间序列数据

time_series = df.set_index('Date')['Confirmed']

拆分训练集和测试集

train = time_series[:int(0.8*len(time_series))]

test = time_series[int(0.8*len(time_series)):]

建立和训练ARIMA模型

model = ARIMA(train, order=(5, 1, 0))

model_fit = model.fit(disp=0)

进行预测

forecast, stderr, conf_int = model_fit.forecast(steps=len(test))

绘制预测结果

plt.figure(figsize=(10, 6))

plt.plot(train, label='Training Data')

plt.plot(test, label='Test Data')

plt.plot(test.index, forecast, label='Forecast')

plt.fill_between(test.index, conf_int[:, 0], conf_int[:, 1], color='k', alpha=0.2)

plt.xlabel('Date')

plt.ylabel('Number of Confirmed Cases')

plt.title('COVID-19 Cases Forecast Using ARIMA')

plt.legend()

plt.show()

2、机器学习模型

机器学习模型也可以用于疫情数据的预测。例如,使用线性回归或LSTM模型进行预测。

from sklearn.linear_model import LinearRegression

import numpy as np

准备数据

X = np.array(range(len(train))).reshape(-1, 1)

y = train.values

建立和训练线性回归模型

model = LinearRegression()

model.fit(X, y)

进行预测

X_test = np.array(range(len(train), len(train) + len(test))).reshape(-1, 1)

y_pred = model.predict(X_test)

绘制预测结果

plt.figure(figsize=(10, 6))

plt.plot(train, label='Training Data')

plt.plot(test, label='Test Data')

plt.plot(test.index, y_pred, label='Forecast')

plt.xlabel('Date')

plt.ylabel('Number of Confirmed Cases')

plt.title('COVID-19 Cases Forecast Using Linear Regression')

plt.legend()

plt.show()

六、交互式图表

交互式图表可以提供更好的用户体验。使用Plotly Dash可以创建交互式的疫情数据仪表盘。

import dash

import dash_core_components as dcc

import dash_html_components as html

from dash.dependencies import Input, Output

初始化Dash应用

app = dash.Dash(__name__)

定义布局

app.layout = html.Div([

dcc.Graph(id='covid-graph'),

dcc.Dropdown(

id='country-dropdown',

options=[{'label': country, 'value': country} for country in df['Country'].unique()],

value='United States'

)

])

定义回调函数

@app.callback(

Output('covid-graph', 'figure'),

[Input('country-dropdown', 'value')]

)

def update_graph(selected_country):

filtered_df = df[df['Country'] == selected_country]

fig = {

'data': [

{'x': filtered_df['Date'], 'y': filtered_df['Confirmed'], 'type': 'line', 'name': 'Confirmed'},

{'x': filtered_df['Date'], 'y': filtered_df['Deaths'], 'type': 'line', 'name': 'Deaths'},

{'x': filtered_df['Date'], 'y': filtered_df['Recovered'], 'type': 'line', 'name': 'Recovered'},

],

'layout': {

'title': f'COVID-19 Cases in {selected_country}'

}

}

return fig

运行应用

if __name__ == '__main__':

app.run_server(debug=True)

七、总结

通过以上步骤,我们可以使用Python绘制各国疫情图表。这包括获取疫情数据、处理数据、绘制图表、进行数据分析与洞察、进行数据预测以及创建交互式图表。在整个过程中,数据的准确性和可视化的清晰度至关重要。通过这些方法和技巧,我们可以更好地了解疫情的趋势和影响,为决策提供数据支持。

绘制疫情图表不仅可以帮助我们理解当前的疫情情况,还可以为未来的疫情防控提供有力的依据。随着技术的不断发展,我们可以使用越来越多的工具和方法来进行数据分析和可视化,从而更好地应对全球性的公共卫生挑战。

相关问答FAQs:

如何获取各国疫情数据以用于Python绘图?
获取各国的疫情数据通常可以通过一些公共API或数据源实现。例如,Johns Hopkins University、World Health Organization(WHO)以及一些开源项目都提供了疫情数据集。可以使用Python的requests库从这些API获取实时数据,或者直接下载CSV文件进行分析。通过这些数据,可以提取各国的感染人数、死亡人数等信息,为绘图提供基础。

使用哪种Python库绘制疫情图表效果最佳?
在Python中,有多个库可以用来绘制疫情图表,包括MatplotlibSeabornPlotlyMatplotlib是最常用的基础绘图库,适合简单的静态图表;Seaborn则是在Matplotlib基础上做的扩展,能够绘制更美观的统计图表。而Plotly非常适合制作交互式图表,用户可以通过鼠标悬停等操作查看详细数据,适合展示复杂的疫情数据。

如何自定义疫情图表的样式和标签?
在Python绘图时,可以通过设置图表的标题、坐标轴标签和图例等来提升图表的可读性和专业性。使用Matplotlib时,可以通过plt.title()设置标题,plt.xlabel()plt.ylabel()设置坐标轴标签。此外,还可以使用颜色、线型和标记样式来区分不同国家的数据。例如,通过plt.plot()中的参数设置,可以选择不同的颜色和线条样式来区分各国疫情走势,从而使图表更具可视化效果。

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